아서 메이건은 1874년 6월 16일 캐나다 온타리오주 엔더슨에서 조지프 메이건과 메리 제인 벨의 아들로 태어났다. 메이건은 세인트 메리에 있는 노스워드 공립학교를 다녔다. 세인트 메리의 첫 교장의 손자인 메이건은 모범적인 학생이었다. 1892년 세인트 메리 교육 과정의 마지막 학년에 문학협회의 총무로 선출되었고, 교내 토론회의 회원으로 활동했다. 그는 수학, 영어 및 라틴어에서 수석을 차지했으며, 토론토 대학에서 고등 교육을 이수하고 1896년 졸업해 수학 학사 학위를 취득했다. 토론토 대학을 다니던 도중 윌리엄 라이언 매켄지 킹을 만나 라이벌이 되기도 했다. 미래의 정치 지도자인 두 사람은 처음부터 사이가 별로 좋지 못했다. 메이건은 이후 오스굿 홀 법학대학을 졸업했다.